ПЦР исследования ГМО
Один из широко применяемых методов определения ГМО основан на полимеразной цепной реакции (ПЦР). Все ПЦР анализы требуют, чтобы последовательность целевой ДНК была известна. Также важным моментом является выделение и очистка ДНК в образце. Технология ПЦР стала единственным надежным методом, позволяющим определить присутствие определенной последовательности ДНК из образцов, содержащих малое количество или плохое качество ДНК.
Методы определения ГМО на основе ПЦР были классифицированы в соответствии с их уровнем специфичности:
- Широко используемые последовательности, такие как P-35S (CaMV 35S промотор), T-35S (CaMV 35S терминатор), T-Nos(терминатор гена нопалин-синтазы), bla (β-lactamase), иnptII (неомицинфосфотрансферазаII);
- Последовательности в пределах интересующего гена (собственно трансгена);
- Конструктивно-специфические последовательности, примером является соединение между промоторной последовательности и самого трансгена;
- Случайно-специфические последовательности, такие как сайт интеграции трансгена.
Количественная ПЦР в реальном времени (QRT-PCR) представляет собой наиболее мощное средство для количественного определения ГМ-культур.
Он работает, непрерывно контролируя реакцию амплификации, используя силу сигнала флуоресценции, чтобы указать количество присутствующего ампликона.
Специфичность QRT-PCR зависит как от химии, используемой для контроля амплификации, так и от контрольно-измерительной аппаратуры, используемой для контроля сигнала.
Перечень оборудования и материалов для комплектации ПЦР лаборатории
Зона пробоподготовки:
- Гомогенизатор
- Весы аналитические до 200г / 0,1 мг
- Весы аналитические до 300 г /1,0 мг
- Набор дозаторов переменного объема 10, 200, 1000 мкл
- Холодильник + морозильная камера
ЗОНА 1.
Для выделения ДНК из проб:
- Ламинарный бокс, класс биологической безопасности II .
- Термостат для пробирок типа «Эппендорф» от 25 до 100 °С.
- Микроцентрифуга для пробирок типа «Эппендорф» до 16 тыс об/мин.
- Вортекс
- Вакуумный отсасыватель медицинский с колбой-ловушкой для удаления надосадочной жидкости.
- Набор дозаторов переменного объема 10, 200, 1000 мкл
- Одноразовые полипропиленовые завинчивающиеся или плотно закрывающиеся микропробирки объемом 1,5 мл.
- Штативы для микропробирок объемом 1,5 мл и наконечники.
- Одноразовые наконечники для дозаторов переменного объема с аэрозольным барьером до 200 и 1000 мкл.
- Одноразовые наконечники для дозаторов переменного объема до 200 мкл.
- Холодильник от 2 до 8 °С с морозильной камерой не выше минус 16 °С.
- Отдельный халат и одноразовые перчатки.
- Емкость с дезинфицирующим раствором.
- Комплект средств для обработки рабочего места.
ЗОНА 2.
- Для ПЦР-амплификации, а также гибридизационно-флуоресцентной детекции продуктов ПЦР-амплификации:
- Амплификатор
- ПЦР-бокс.
- Вортекс.
- Набор дозаторов переменного объема 10, 200, 1000 мкл
- Для приборов, в зависимости от модели:
- одноразовые полипропиленовые микропробирки для ПЦР на 0,2 мл (плоская крышка, нестрипованные).
- одноразовые полипропиленовые микропробирки для ПЦР на 0,2 мл
- стрипованные пробирки с куполообразной крышкой или 96-луночный планшет для ПЦР, снабженный термостабильными оптически прозрачными пленками.
- Одноразовые наконечники для дозаторов переменного объема с аэрозольным барьером до 200 мкл.
- Штативы для наконечников и микропробирок объемом 0,2 мл.
- Холодильник от 2 до 8 °С.
- Отдельный халат и одноразовые перчатки.
- Емкость с дезинфицирующим раствором.
- Комплект средств для обработки рабочего места.